Universitas Jenderal Achmad Yani Yogyakarta (Unjaya) menempatkan penjaminan mutu sebagai fondasi utama dalam mewujudkan visi sebagai perguruan tinggi unggul, berwawasan global dan berperan aktif dalam penguatan ketahanan nasional, dengan semangat kejuaangan Jenderal Achmad Yani. Sistem penjaminan mutu Unjaya dirancang secara komprehensif dan berkelanjutan untuk menjamin tercapainya standar akademik, tata kelola, serta layanan pendidikan yang bermutu tinggi.
Dengan penerapan penjaminan mutu yang sistematis dan terukur, Unjaya memastikan seluruh proses akademik dan kelembagaan berjalan dengan efektif, efisien, serta responsif terhadap dinamika dunia pendidikan tinggi.