Fkes Unjani Yogyakarta dibangun secara terpadu diatas lahan seluas 12.000 m2 dan dilengkapi dengan ruang kuliah yang representatif, laboratorium berstandar internasional, dan didukung berbagai fasilitas penunjang pendidikan diantaranya:
- Laboratorium Keperawatan (Skil Lab Medical Bedah, Skil Lab Kebutuhan Dasar Manusia, Skil Lab Gerontik, Skil Lab Laboratory Mother, Skil Lab Perawatan Anak, Skil Lab Tumbuh Kembang, Skil Lab Biomedik).
- Laboratorium Kebidanan (Skil Lab. KB, Skil Lab. Micro Teaching, Skil Lab. BBL / Neonatus. Skil Lab. Biomedik, Skil Lab. Nifas, Skil Lab. Persalinan, Skil Lab. Pemeriksaan Kehamilan)
- Laboratorium Farmasi
- Laboratorium Bank Darah
- Laboratorium Komputer
- Laboratorium CBT
- Asrama Mahasiswa
- Masjid Al Mukhlish
- Area olah raga
- Hotspot Area
- RS. DKT dr. Soedjono Magelang sebagai home based praktik klinik